生物有機肥是指特定功能微生物與主要以動植物殘體(如畜禽糞便、農作物秸稈等)為來源并經無害化處理、腐熟的有機物料復合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。

生物有機肥產品的上游主要為原料供應商，主要包括農業廢料(如米糠、牲畜糞便、酵母渣、稻殼秸稈、餐廚余生活垃圾、河床污泥魚糞、中藥渣茶葉渣、豆粕豆渣油脂等)、化學原材料(如尿素、硫酸鉀、硝酸鉀等)等。這些行業屬于充分競爭市場，市場供給充足，對行業影響較小。生物有機肥行業的下游行業為農業種植，種植業的發展水平對生物有機肥行業的影響較大。

目前，我國生物有機肥行業還存在不少問題：首先，目前生物有機肥行業企業規模小，產品在肥料行業中所占比重低。雖然我國目前的生物有機肥生產企業已有1000多家，但多為中小型企業，生產規模多數偏小。菌劑類企業年產量一般在幾百噸左右，超過上萬噸的廠家屈指可數;而菌肥類企業年產量多在0.5-1萬噸左右，少數企業能達到4-5萬噸，只有個別企業達到10萬噸以上。目前生物有機肥年產量已達到300萬噸以上，這還是得益于近年來菌肥類產品的快速發展。雖然產量較前幾年有了較大的提高，但在整個肥料行業中所占比重仍很低，行業中還沒有涌現出知名或旗艦型的企業。

其次，產品質量參差不齊，作用效果不穩定。從行業的整體來看，部分企業還存在設備簡陋、生產工藝落后、產品質量不高等現象。特別是近年來新加入的一些菌肥類企業，這些企業一般不具備生產微生物菌劑的能力，而是通過購買菌劑進行復配來生產菌肥類產品。由于缺少相關的檢測條件和技術人員，無法對產品的質量進行把關，也就不能保證產品的應用效果。此外，生物有機肥作為含有活菌制劑的肥料產品，作用效果受施用方法、環境條件等方面的限制，生物有機肥產品的作用效果不是非常穩定，這也影響了生物有機肥產品的進一步推廣、應用。

雖然，我國生物有機肥行業存在不少問題，但仍然取得了一些發展，近年來，我國生物有機肥行業快速發展，在肥料行業中的地位日益得到重視。行業內生產企業總數、總產量和產品種類都有較大幅度的增長。行業內已有若干企業組建了自己的工程技術中心，或與高等院校、科研單位聯合，形成產、學、研機構，有一部分企業爭取到國家的產業化示范項目，全行業已經初步建立了標準體系和質檢體系，產品質量狀況逐步得到改善，應用效果得到農民認可。

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